| MTÜ FuntimeMittetulundusühing | 80560233 | Lasnamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 15.01.20197 aastat |
| MTÜ FUFFMittetulundusühing | 80282596 | Tiilige küla, Setomaa vald, Võru maakondVõru maakond | 25.02.200917 aastat |
| MTÜ Free RidersMittetulundusühing | 80652455 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 05.03.20251 aastat |
| MTÜ FortissimoMittetulundusühing | 80349981 | Tsirguliina alevik, Valga vald, Valga maakondValga maakond | 22.11.201213 aastat |
| MTÜ FORTE MCCMittetulundusühing | 80583547 | Ülenurme alevik, Kambja vald, Tartu maakondTartu maakond | 30.07.20205 aastat |
| MTÜ FerminoMittetulundusühing | 80568588 | Lasnamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 13.08.20196 aastat |
| MTÜ FavorlyMittetulundusühing | 80568714 | Väike-Maarja alevik, Väike-Maarja vald, Lääne-Viru maakondLääne-Viru maakond | 14.08.20196 aastat |
| MTÜ EventssquadMittetulundusühing | 80582097 | Rannamõisa küla, Harku vald, Harju maakondHarju maakond | 11.06.20206 aastat |
| MTÜ EveMarMittetulundusühing | 80326572 | Valga linn, Valga vald, Valga maakondValga maakond | 19.04.201115 aastat |
| MTÜ EttevõtlusmajaMittetulundusühing | 80595125 | Mustajõe küla, Põlva vald, Põlva maakondPõlva maakond | 14.04.20215 aastat |
| MTÜ ESTO PeakomiteeMittetulundusühing | 80417719 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 15.05.20179 aastat |
| MTÜ Estonian Indian Cultural & Business AssociationMittetulundusühing | 80409364 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 22.11.20169 aastat |
| MTÜ Estonian Fight ClubMittetulundusühing | 80603416 | Lasnamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 08.11.20214 aastat |
| MTÜ EstherMittetulundusühing | 80637757 | Põhja-Tallinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 05.03.20242 aastat |
| MTÜ EnergilisedMittetulundusühing | 80615885 | Sindi linn, Tori vald, Pärnu maakondPärnu maakond | 19.09.20223 aastat |
| MTÜ Energia- ja TervisekeskusMittetulundusühing | 80369067 | Peetri alevik, Järva vald, Järva maakondJärva maakond | 01.04.201412 aastat |
| MTÜ "Endla Looduse Selts – Endla Looduskaitseala toetuseks"Mittetulundusühing | 80658377 | Endla küla, Jõgeva vald, Jõgeva maakondJõgeva maakond | 01.08.20250 aastat |
| MTÜ Emajõe FestivalMittetulundusühing | 80569323 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 28.08.20196 aastat |
| MTÜ EluolualusMittetulundusühing | 80639302 | Tudulinna küla, Alutaguse vald, Ida-Viru maakondIda-Viru maakond | 09.04.20242 aastat |
| MTÜ Elu & MeluMittetulundusühing | 80668002 | Nõmme linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 09.02.20260 aastat |
| MTÜ e-lapsMittetulundusühing | 80422620 | Narva linn, Ida-Viru maakondIda-Viru maakond | 05.09.20178 aastat |
| MTÜ Eksootiline SõprusMittetulundusühing | 80645567 | Liikva küla, Harku vald, Harju maakondHarju maakond | 27.09.20241 aastat |
| MTÜ EistulfarnirMittetulundusühing | 80593095 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 23.02.20215 aastat |
| MTÜ Eesti Veinikultuuri ArengMittetulundusühing | 80607727 | Voika küla, Nõo vald, Tartu maakondTartu maakond | 21.02.20224 aastat |
| MTÜ Eesti Pereettevõtjate LiitMittetulundusühing | 80371532 | Lasnamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 09.06.201412 aastat |
| MTÜ Eesti Maja KeeniasMittetulundusühing | 80665475 | Tähtvere küla, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 15.12.20250 aastat |
| MTÜ Eesti Lugemiskoerte ÜhingMittetulundusühing | 80406489 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 19.09.20169 aastat |
| MTÜ EAST RIDERS MC JÕHVIMittetulundusühing | 80611864 | Jõhvi linn, Jõhvi vald, Ida-Viru maakondIda-Viru maakond | 23.05.20224 aastat |
| MTÜ Eakate Kultuuri - ja haridusselts "Silveryears"Mittetulundusühing | 80567070 | Põhja-Tallinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 26.06.20197 aastat |
| MTÜ Eakate FestivalMittetulundusühing | 80419517 | – | 21.06.20179 aastat |