| MTÜ ErilisedMittetulundusühing | 80574324 | Kristiine linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 06.12.20196 aastat |
| MTÜ Elva Valguskoda - Tervise ja Heaolu KeskusMittetulundusühing | 80616471 | Elva linn, Elva vald, Tartu maakondTartu maakond | 30.09.20223 aastat |
| MTÜ Elus FondMittetulundusühing | 80375926 | Lasnamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 10.10.201411 aastat |
| MTÜ ElupuuMittetulundusühing | 80654193 | Järve linnaosa, Kohtla-Järve linn, Ida-Viru maakondIda-Viru maakond | 11.04.20251 aastat |
| MTÜ Elujõulisem RaplaMittetulundusühing | 80368406 | Rapla linn, Rapla vald, Rapla maakondRapla maakond | 20.03.201412 aastat |
| MTÜ ELSSMittetulundusühing | 80593600 | Uuemõisa alevik, Haapsalu linn, Lääne maakondLääne maakond | 04.03.20215 aastat |
| MTÜ ELEKS FoundationMittetulundusühing | 80628451 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 06.07.20233 aastat |
| MTÜ Elamuste KorraldamineMittetulundusühing | 80636373 | Koosa küla, Peipsiääre vald, Tartu maakondTartu maakond | 30.01.20242 aastat |
| MTÜ EikellegimaaMittetulundusühing | 80423571 | Tellaste küla, Võru vald, Võru maakondVõru maakond | 21.09.20179 aastat |
| MTÜ Eesti VastupidavusMittetulundusühing | 80675338 | Rõõmu küla, Luunja vald, Tartu maakondTartu maakond | 14.07.20260 aastat |
| MTÜ Eesti Toitumisteadlikkuse ArenduskeskusMittetulundusühing | 80275515 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 03.10.200817 aastat |
| MTÜ Eesti Teotonio VennaskondMittetulundusühing | 80671853 | Pirita linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 22.04.20260 aastat |
| MTÜ Eesti Leegioni Sõprade KlubiMittetulundusühing | 80281680 | Lihula linn, Lääneranna vald, Pärnu maakondPärnu maakond | 16.03.200917 aastat |
| MTÜ Eesti Küberfüüsika KodaMittetulundusühing | 80659629 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 29.08.20251 aastat |
| MTÜ Eesti-Kreeka Kultuurikeskus ja KaubanduskodaMittetulundusühing | 80591222 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 14.01.20215 aastat |
| MTÜ Eesti korvpalli edendaja Viljar KuusmaaMittetulundusühing | 80619699 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 14.12.20223 aastat |
| MTÜ EESTI KOOLITOIDU LIITMittetulundusühing | 80597971 | Ülejõe küla, Rae vald, Harju maakondHarju maakond | 16.06.20215 aastat |
| MTÜ Eesti Kinnisvara Korrashoiu LiitMittetulundusühing | 80102849 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 01.07.199927 aastat |
| MTÜ Eesti Kalmistute LiitMittetulundusühing | 80663393 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 10.11.20250 aastat |
| MTÜ Eesti AustriakadeemiaMittetulundusühing | 80640110 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 29.04.20242 aastat |
| MTÜ E.E.Sauenberg HTFMittetulundusühing | 80639555 | Mustamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 15.04.20242 aastat |
| MTÜ EDUMEELMittetulundusühing | 80606567 | Põhja-Tallinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 26.01.20224 aastat |
| MTÜ DOPOMOGA UAMittetulundusühing | 80620627 | Lasnamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 09.01.20233 aastat |
| MTÜ DietoloogMittetulundusühing | 80384061 | Meegomäe küla, Võru vald, Võru maakondVõru maakond | 15.04.201511 aastat |
| MTÜ Breastfeeding Support CentreMittetulundusühing | 80560776 | Jõhvi linn, Jõhvi vald, Ida-Viru maakondIda-Viru maakond | 25.01.20197 aastat |
| MTÜ Blue Shield InternationalMittetulundusühing | 80595415 | Nõmme linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 20.04.20215 aastat |
| MTÜ Black Sea Policy InstituteMittetulundusühing | 80651639 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 17.02.20251 aastat |
| MTÜ BEV HeategevusühingMittetulundusühing | 80617016 | Pärnu linn, Pärnu linn, Pärnu maakondPärnu maakond | 13.10.20223 aastat |
| MTÜ BELARUSIAN INDEPENDENT FILM ACADEMYMittetulundusühing | 80621265 | Põhja-Tallinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 19.01.20233 aastat |
| MTÜ BBD Global FoundationMittetulundusühing | 80655815 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 22.05.20251 aastat |