| Sihtasutus Eesti Maaülikooli MahekeskusSihtasutus | 90011326 | Õssu küla, Kambja vald, Tartu maakondTartu maakond | 14.10.200817 aastat |
| Sihtasutus Eesti TeadusagentuurSihtasutus | 90000759 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 28.05.199828 aastat |
| Sihtasutus RAEKSihtasutus | 90013868 | Rapla linn, Rapla vald, Rapla maakondRapla maakond | 09.06.20179 aastat |
| Sihtasutus Rahvusvaheline Kaitseuuringute KeskusSihtasutus | 90009217 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 12.07.200619 aastat |
| Siid OÜOÜOsaühing | 10426639 | Haapsalu linn, Haapsalu linn, Lääne maakondLääne maakond | 13.04.199828 aastat |
| SIISI OÜOÜOsaühing | 11376323 | Vääna küla, Harku vald, Harju maakondHarju maakond | 26.04.200719 aastat |
| Siiteh OÜOÜOsaühing | 16667634 | Tõhelgi küla, Raasiku vald, Harju maakondHarju maakond | 02.02.20233 aastat |
| Siland Group OÜOÜOsaühing | 16446070 | – | 18.02.20224 aastat |
| Silektron OÜOÜOsaühing | 17415969 | Narva linn, Ida-Viru maakondIda-Viru maakond | 19.01.20260 aastat |
| Silicon Port MTÜMittetulundusühing | 80626185 | Puka alevik, Otepää vald, Valga maakondValga maakond | 08.05.20233 aastat |
| Silkest OÜOÜOsaühing | 14721795 | Narva-Jõesuu linn, Narva-Jõesuu linn, Ida-Viru maakondIda-Viru maakond | 13.05.20197 aastat |
| Sillen Stiil OÜOÜOsaühing | 11936199 | Mustamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 05.05.201016 aastat |
| Silvanter Forest OÜOÜOsaühing | 12220020 | Raadi alev, Tartu vald, Tartu maakondTartu maakond | 16.01.201214 aastat |
| Sinilevi OÜOÜOsaühing | 14895271 | Saareküla, Saaremaa vald, Saare maakondSaare maakond | 23.01.20206 aastat |
| Sinu Arvestusabi OÜOÜOsaühing | 12227743 | Nõmme linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 30.01.201214 aastat |
| Sirtsi Arendus OÜOÜOsaühing | 17358763 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 27.10.20250 aastat |
| Sisekliima OÜOÜOsaühing | 16876823 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 11.12.20232 aastat |
| Sisne OÜOÜOsaühing | 16116118 | Haabneeme alevik, Viimsi vald, Harju maakondHarju maakond | 07.12.20205 aastat |
| SISU Advisory OÜOÜOsaühing | 12334203 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 27.08.201213 aastat |
| Sivihit OÜOÜOsaühing | 12747785 | Liikva küla, Harku vald, Harju maakondHarju maakond | 05.11.201411 aastat |
| SIXTEEN LEGACY OÜOÜOsaühing | 17048689 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 14.08.20241 aastat |
| Skin Safe OÜOÜOsaühing | 16123839 | Põhja-Tallinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 18.12.20205 aastat |
| SKLA OÜOÜOsaühing | 16642315 | Võõpsu küla, Setomaa vald, Võru maakondVõru maakond | 30.12.20223 aastat |
| SKYMALL OÜOÜOsaühing | 16508031 | Rakvere linn, Lääne-Viru maakondLääne-Viru maakond | 26.05.20224 aastat |
| SkyNet Media OÜOÜOsaühing | 14882185 | Kristiine linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 07.01.20206 aastat |
| Skynord OÜOÜOsaühing | 17250579 | Lasnamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 28.05.20251 aastat |
| SLD Consult OÜOÜOsaühing | 14008169 | Laagri alevik, Saue vald, Harju maakondHarju maakond | 07.03.201610 aastat |
| SleepConsult OÜOÜOsaühing | 16135015 | Kristiine linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 08.01.20215 aastat |
| Slevin OÜOÜOsaühing | 16664340 | Kuressaare linn, Saaremaa vald, Saare maakondSaare maakond | 30.01.20233 aastat |
| SLLM HOLDINGS OÜOÜOsaühing | 14676362 | Kristiine linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 06.03.20197 aastat |