| MTÜ Märjamaa Gümnaasiumi VilistlaskoguMittetulundusühing | 80595214 | Märjamaa alev, Märjamaa vald, Rapla maakondRapla maakond | 16.04.20215 aastat |
| MTÜ MatkakultuurMittetulundusühing | 80625116 | Aegviidu alev, Anija vald, Harju maakondHarju maakond | 11.04.20233 aastat |
| MTÜ MeeleheaMittetulundusühing | 80669183 | Jüri alevik, Rae vald, Harju maakondHarju maakond | 03.03.20260 aastat |
| MTÜ Meeste Koda Haapsalu KuurMittetulundusühing | 80602983 | Uuemõisa alevik, Haapsalu linn, Lääne maakondLääne maakond | 28.10.20214 aastat |
| MTÜ Meie LeieMittetulundusühing | 80637964 | Leie küla, Viljandi vald, Viljandi maakondViljandi maakond | 11.03.20242 aastat |
| MTÜ Meie Perekonna HeaksMittetulundusühing | 80429177 | Rapla linn, Rapla vald, Rapla maakondRapla maakond | 06.12.20178 aastat |
| MTÜ Mercedes-Benz Eesti klubiMittetulundusühing | 80188928 | Kristiine linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 11.07.200323 aastat |
| MTÜ MetakriitikaMittetulundusühing | 80427072 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 10.11.20178 aastat |
| MTÜ MidrilinnudMittetulundusühing | 80376044 | Tsirguliina alevik, Valga vald, Valga maakondValga maakond | 14.10.201411 aastat |
| MTÜ militaar.netMittetulundusühing | 80651148 | Lasnamäe linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 05.02.20251 aastat |
| MTÜ MiMeNoMittetulundusühing | 80417180 | Rakvere linn, Lääne-Viru maakondLääne-Viru maakond | 05.05.20179 aastat |
| Mtü Mitika matkadMittetulundusühing | 80614167 | Haapsalu linn, Haapsalu linn, Lääne maakondLääne maakond | 01.08.20224 aastat |
| MTÜ ML ProjektidMittetulundusühing | 80407098 | Kohila alev, Kohila vald, Rapla maakondRapla maakond | 02.10.20169 aastat |
| MTÜ MNNMittetulundusühing | 80611443 | Tabasalu alevik, Harku vald, Harju maakondHarju maakond | 11.05.20224 aastat |
| MTÜ MOGAMI JAAPANI TOIDUKULTUURI INSTITUUTMittetulundusühing | 80671636 | Kesklinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 15.04.20260 aastat |
| MTÜ MOJOS EventsMittetulundusühing | 80555924 | Puhja alevik, Elva vald, Tartu maakondTartu maakond | 11.10.20187 aastat |
| MTÜ MOTOKLUBI BALTIC BIRDS MCCMittetulundusühing | 80401693 | Sillamäe linn, Ida-Viru maakondIda-Viru maakond | 18.05.201610 aastat |
| MTÜ Motoklubi SõltumatudMittetulundusühing | 80384820 | Tartu linn, Tartu linn, Tartu maakondTartu maakond | 28.04.201511 aastat |
| MTÜ MudVenturesMittetulundusühing | 80636893 | Papsaare küla, Pärnu linn, Pärnu maakondPärnu maakond | 09.02.20242 aastat |
| MTÜ Muinasjututaat JaakMittetulundusühing | 80624559 | Pärnu linn, Pärnu linn, Pärnu maakondPärnu maakond | 29.03.20233 aastat |
| MTÜ Mulgi RahatarkusMittetulundusühing | 80659279 | Vana-Võidu küla, Viljandi vald, Viljandi maakondViljandi maakond | 21.08.20250 aastat |
| MTÜ MullaketrajadMittetulundusühing | 80632335 | Põhja-Tallinna linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 11.10.20232 aastat |
| MTÜ Mulligalerii VabateaterMittetulundusühing | 80654371 | Pärnu linn, Pärnu linn, Pärnu maakondPärnu maakond | 17.04.20251 aastat |
| MTÜ Muru PiirilMittetulundusühing | 80631453 | Muru küla, Rakvere vald, Lääne-Viru maakondLääne-Viru maakond | 22.09.20232 aastat |
| MTÜ Müüdud NaerMittetulundusühing | 80397721 | Võru linn, Võru maakondVõru maakond | 23.02.201610 aastat |
| MTÜ Muuvi StuudioMittetulundusühing | 80581212 | Abja-Paluoja linn, Mulgi vald, Viljandi maakondViljandi maakond | 14.05.20206 aastat |
| MTÜ Naiskoor MeelikaMittetulundusühing | 80233864 | Kose-Uuemõisa alevik, Kose vald, Harju maakondHarju maakond | 13.03.200620 aastat |
| MTÜ Naiskoor SüdamehäälMittetulundusühing | 80642511 | Pirita linnaosa, Tallinn, Harju maakondHarju maakond | 08.07.20242 aastat |
| MTÜ Naisrahvatantsurühm TammikuMittetulundusühing | 80394326 | Tammiku alevik, Jõhvi vald, Ida-Viru maakondIda-Viru maakond | 09.12.201510 aastat |
| MTÜ Naiste OffroadMittetulundusühing | 80618139 | Ülenurme alevik, Kambja vald, Tartu maakondTartu maakond | 03.11.20223 aastat |